碳同位素（13C）可以指示碳源和土壤再生途径。
研究发现，土壤碳同位素值随着土壤深度的增加而逐渐增加，而土壤碳含量则逐渐减少。
这是由于以下原因引起的：首先，化石燃料的燃烧逐渐增加了大气中贫化的碳，并且贫化的有机物在13°C的土壤表面累积。其次，根系碳同位素比植物高1-2个单位，而较低的土壤同位素比地表土壤高。第三是土壤中有机物分解过程中的碳分离。这通过呼吸从系统中释放出12C，13C积聚在土壤中形成碳同位素。深度增加信号倾向于增加。
许多研究表明，有机土壤碳的微生物降解是随着深度增加土壤13 C的主要原因，这种趋势可能有效地表明了土壤碳的自转速率。有。